(—)介紹
過去25年,顯色培養(yǎng)基在臨床獲得了廣泛的應(yīng)用。過去10年,顯色培養(yǎng)基的檢測范圍不斷擴大,已包括銅綠假單胞菌、B族鏈球菌、艱難梭菌、彎曲菌、小腸結(jié)腸炎耶爾森菌以及一些耐藥菌等。
顯色培養(yǎng)基檢測目標(biāo)菌,是基于它們的酶活性。然而,這些酶活性并非100%菌種特異性的,因此還需使用酶底物作為代謝物以及選用選擇因子。
大部分的顯色培養(yǎng)基同時有選擇和鑒別功能,能抑制無關(guān)菌群。它使得目標(biāo)菌產(chǎn)生特別顏色,從而減少了待檢菌的數(shù)量。它減少了勞動量,減少了試劑的使用,所需使用的生化試劑和血清學(xué)試劑更少。它能快速確證病原菌,減少了出報告的總花費時間。因為致病菌菌落帶有顏色,比較顯著,而不會被漏檢,因而改善了的檢出率。
(二)病原菌的檢測
臨床用于致病菌檢測的顯色培養(yǎng)基已有不少種,和傳統(tǒng)培養(yǎng)基相比,顯色培養(yǎng)基需要更少的驗證試驗,尤其對于那些近似目標(biāo)菌的伴生菌。顯色培養(yǎng)基的鑒別能力還體現(xiàn)在念珠菌顯色培養(yǎng)基上。和傳統(tǒng)的沙氏氯霉素平板相比,念珠菌顯色瓊脂可以鑒別不同種的念珠菌,而且還有助于耐藥念珠菌的檢測。
志賀菌產(chǎn)生的酶較少,因而限制了顯色培養(yǎng)基的開發(fā)。然而,現(xiàn)在已發(fā)現(xiàn)所有志賀菌物種都合成β-核糖苷酶(ribosidase),可作為顯色培養(yǎng)基開發(fā)的基礎(chǔ)。
產(chǎn)志賀毒素大腸桿菌(STEC)受到臨床的重視。但一些STEC的血清型菌種發(fā)酵山梨醇,因而限制了山梨醇麥康凱瓊脂的臨床應(yīng)用。
從糞便中分離小腸結(jié)腸炎耶爾森菌,常用CIN瓊脂,它是基于該致病菌以甘露醇發(fā)酵為基礎(chǔ)。但CIN瓊脂的局限是,一些其他腸桿菌科也能生長和發(fā)酵甘露醇。而顯色培養(yǎng)基則能提高特異性。
圖.HiMedia的小腸結(jié)腸炎耶爾森菌顯色培養(yǎng)基,貨號M2025(需添加劑FD034)
不動桿菌,尤其是鮑曼不動桿菌,是重要的院內(nèi)病原體。對碳青霉烯類抗生素有耐藥性的不動桿菌已引起了廣泛關(guān)注,因為這些耐藥菌非常難以治療。曾有人評估不動桿菌顯色培養(yǎng)基的靈敏度和特異性分別為91.7%和89.6%。
圖.HiMedia不動桿菌顯色培養(yǎng)基,貨號M1938(需添加劑FD271)
(三)實驗室自動化對顯色培養(yǎng)基應(yīng)用的影響
過去10年,臨床實驗室的顯著變化是引入了MALDI-TOF質(zhì)譜用于快速準(zhǔn)確的鑒定微生物物種。但對于診斷來說,先行培養(yǎng)仍然是大部分MALDI-TOF的先決條件。MALDI-TOF只是顯色培養(yǎng)基的輔助手段。由于沒有哪個顯色培養(yǎng)基能保證的特異性,因而需要進(jìn)一步的菌種鑒定。
MALDI-TOF的主要好處是將病原菌的鑒定時間減少到1個小時以內(nèi),并降低了鑒定的成本。MALDI-TOF質(zhì)譜能彌補一些培養(yǎng)基特異性缺乏的問題,但不能解決培養(yǎng)基靈敏度的問題。
實驗室自動化涵蓋了樣本的平板接種、菌落自動計數(shù)和分析。數(shù)字自動成像軟件可以觀察到菌落顏色像素的差異。顯色培養(yǎng)基特別適合數(shù)字自動化??梢栽谲浖显O(shè)定顏色閾限,以區(qū)分出目標(biāo)菌。其他有好幾項研究也發(fā)現(xiàn),數(shù)字成像可以彌補一開始人為讀數(shù)的漏檢。
(四)顯色培養(yǎng)基和分子診斷方法的比較
PCR、生物芯片和全基因組測序在臨床診斷實驗室已獲得了應(yīng)用。它們和傳統(tǒng)培養(yǎng)法一起,同樣存在方法上的利弊。個考慮因素是靈敏度。有研究發(fā)現(xiàn),PCR和顯色培養(yǎng)基培養(yǎng)法對于篩查艱難梭菌和萬古霉素耐藥的腸球菌具有
同等的靈敏度。然而,艱難梭菌培養(yǎng)后還需對毒素基因進(jìn)行證實,而PCR的好處是一次即可同時完成。對于無乳鏈球菌,有報道說PCR法比顯色培養(yǎng)基法更靈敏,但在肉湯增菌后,兩種方法的靈敏度則沒有區(qū)別。另有研究顯示,對于MRSA的檢測,如果有增菌這一步或者孵育時間達(dá)到48h,顯色培養(yǎng)基的靈敏度是不亞于PCR的。
對于胃腸炎,傳統(tǒng)診斷比較費事,需要培養(yǎng)(包括肉湯增菌)、鏡下觀察和免疫方法檢測。對于一些病原菌如STEC,分子診斷比培養(yǎng)法更有優(yōu)勢。有人對13974個糞便樣本進(jìn)行檢驗,發(fā)現(xiàn)除了沙門氏菌之外,其他如空腸彎曲菌、志賀菌等,多重PCR法比傳統(tǒng)培養(yǎng)法更有優(yōu)勢。有些商品化的平臺還可自動完成核酸提取、逆轉(zhuǎn)錄和擴增、分析,可在1小時內(nèi)檢測22種病原體。
PCR結(jié)果可在幾小時內(nèi)出來,而培養(yǎng)法要在18h-48h后。但PCR比培養(yǎng)法的價格要高。對耐藥菌和耐藥基因同時檢測時,應(yīng)進(jìn)行方法互補。如果PCR法發(fā)現(xiàn)了耐藥基因,則通過培養(yǎng)法檢出耐藥菌,并對該菌種并進(jìn)行藥敏試驗??傊?,培養(yǎng)法分離病原體仍然是一種重要方法,它可進(jìn)行藥敏試驗,監(jiān)測感染的爆發(fā),并將感染原因與初源頭(如污染的食品)聯(lián)系起來。
盡管分子方法看上去存在一些優(yōu)勢,但也仍存在些固有不足。如:對藥敏試驗前需先分離病原菌,這一點PCR法無法實現(xiàn)。PCR的另一個問題是存在新基因和基因變異。例如,一個病原體攜帶一個耐藥新基因,它可能逃避PCR的檢測,而它因為表達(dá)耐藥表型,卻能被顯色培養(yǎng)基給檢出來。
參考文獻(xiàn):
Perry JD. 2017. A decade of development of chromogenic culture media
for clinical microbiology in an era of molecular diagnostics. Clin Microbiol Rev. 30:449–479.
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