環(huán)狀RNA (circRNAs)在正常細(xì)胞和癌細(xì)胞中越來越多地參與各種功能,它是由細(xì)胞核中前體mRNA的反向剪接形成的。環(huán)狀RNA(circular RNA)是一類在真核細(xì)胞中廣泛存在的非編碼RNA,具有多樣的功能和調(diào)控機(jī)制。在進(jìn)行相關(guān)實(shí)驗(yàn)時(shí),使用適當(dāng)?shù)脑噭┖泻头椒ㄌ崛…h(huán)狀RNA,考慮到其結(jié)構(gòu)上的特殊性,確保在提取過程中避免環(huán)狀RNA的降解。環(huán)狀RNA主要定位于細(xì)胞質(zhì)中,這表明它們必須從細(xì)胞核輸出。
RNA相關(guān)研究,需要嚴(yán)格控制實(shí)驗(yàn)室衛(wèi)生環(huán)境,避免出現(xiàn)雜質(zhì)核酸和核酸酶污染。德國MB公司生產(chǎn)的即用型核酸污染清除噴霧劑——PCR Clean,直接作用于實(shí)驗(yàn)環(huán)境、實(shí)驗(yàn)器材,高效清除核酸污染。
近日,發(fā)表在《Nature》上,標(biāo)題為:“Nuclear export of circular RNA"的一篇研究中,科研人員確定了一個(gè)途徑,是特定的環(huán)狀RNA的核輸出。
該通路需要Ran-GTP、exportin-2和IGF2BP1。通過消耗或化學(xué)抑制主要蛋白輸出蛋白CRM1來增強(qiáng)核Ran-GTP梯度,可選擇性地增加circRNAs的核輸出,而降低核Ran-GTP梯度可選擇性地阻斷circRNA的輸出。export -2的缺失或敲除特異性地抑制circRNA的核輸出。核circRNA結(jié)合蛋白分析表明,Ran-GTP增強(qiáng)了IGF2BP1與circRNA之間的相互作用。Ran-GTP通過與export -2、circRNA和IGF2BP1的相互作用,促進(jìn)細(xì)胞核內(nèi)circRNA輸出復(fù)合物的形成。我們的研究結(jié)果表明,直接結(jié)合環(huán)狀rna的適配器如IGF2BP1,以類似于蛋白質(zhì)輸出而不是mRNA輸出的機(jī)制招募Ran-GTP和export -2來輸出環(huán)狀RNA。